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1992年10月建校,原名“高等中医院校骨伤研究会中医培训学校”，以充分利用高等院校师资，推广传统中医疗法为宗旨；

1998年5月，学校正式更名为“北京高等中医药培训学校”，注册地址为北京中医药大学东直门医院；学校以北京中医药大学及临床医院、中国中医研究院（现已更名为中国中医科学院）及附属医院的专家、教授团队为基础，面向全国推广中西医特色医疗技术；

1999年7月，由于北京中医药大学东直门医院教学场地比较紧张，学校的办公地点转到医院的上级主管---北京中医药大学院内；学校办公地点为北京中医药大学基础医学院一层135室，之后几年内135室基本成为中医培训界内的知名品牌，也成为北京高等中医药培训学校的代名词；在之后的几年内，全国大量的投机资本开始涌入医学培训领域，培训市场也开始被投机办学者搞得日渐混乱；而北京高等中医药培训学校始终坚持诚信办学的原则，获得了业界的好评；在很多游资办学逐步退出医学培训市场的今天，学校仍然巍然屹立！

随着学员的增多，很多学员希望得到更多的交流机会，2000年7月北京高等中医药培训学校与中国中医药学会联合举办了全国首届“专科专病中西医经验交流大会”，并在2001年、2002年连续举办了3年；后来由于社会上各种学术会议激增，学员有更多的选择机会，加上2003年非典影响，论文会暂时停止；

随着学校知名度的增高，很多国外学员慕名而来；2000年7月，举办了首个国际培训班，为韩国一家专业按摩机构培训技术人员，并与其达成长期委培计划，学校连续3年为其培训了近百名专业按摩技师；

2000年7月，为支持参加本校学习班的学员，使他们在学校学习完技术的同时，可以马上回去迅速开展，以尽快造福于患者，并增加经济效益，学校决定成立对外合作部，发展对外合作门诊，向学员提供名义支持。对于部分学员专科，同时协助他们联络有关专家前往坐诊，受到了学员们的普遍欢迎；

2000年11月，学校创办学友会，并发行内部刊物《学友之家》杂志，用于促进学生之间的学术经验交流，提高临床医疗水平；

2000年11月，学校聘请药刀新技术发明人陕俊平教授举办全国首届药刀疗法培训班，为学员们提供了一种比普通针刀疗法更先进的技术，受到了各级医务工作者的热烈欢迎！学校也被指定为药刀疗法唯一的培训基地，随着技术的不断升级换代，使药刀治疗靶向微创化。药刀靶治新技术专栏：>>>>>>>>>>>>>>>

2000年11月，学校与北京天人信医疗保健科技有限公司联手在全国首次推出药浴疗法的专业培训，并可与学员共同成立药浴专科门诊。此举推动了传统药浴疗法在中国的发展，并为许多不景气的医疗机构注入了新的生机；

2000年12月，学校充分发挥自身的招生优势，协助北京中医药大学远程教育学院进行招生、考试、日常教学的管理等工作。使符合招生条件的学生可以进一步提升自己的临床理论水平，并提升学历；截止2005年，学校已招收中医、针灸、中药、护理、公共事业管理、工商管理各层次学员3000多人；

2001年3月，举办全国首期“董氏奇穴特效针灸班”，聘请美国著名针灸专家、董氏奇穴嫡传弟子杨维杰先生之入室弟子左长波硕士授课。本班取得圆满成功，受到了学员的普遍欢迎。董氏奇穴也以其神奇的效果，在国内广为传颂。目前，由于左老师北澳门一家医疗机构长期聘用，培训班暂停；

2001年3月，应学生们的强烈要求，为满足学生学习各种技术的渴望，学校改变了过去每月只有几个班的招生计划，开始增加培训班的种类及频率，使各类培训班达到每月近十个，每年百余个的规模。学校因此一跃成为全国同行业培训学校内举办培训班最多，规模最大的培训机构；

2001年11月，本校与浙江瑞安市医学会 中医分会合作成功地举办了“中医医疗中级推拿培训班”，招生60余人，由医学会负责招生，结业后由本校发放“中英文对照的钢印结业证书”；

2002年1月份与韩国同类学校共同举办“足底按摩培训班”，并在以后的几年内扩大了国际培训合作的规模；

2002年10月，学校与日本东洋医学疗术专门学院联合举办高级按摩师培训班，并为学生举办了隆重的毕业典礼及送行餐会，受到了日方学校的高度赞誉，并确立了长期合作关系；